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La décrue s'amorce enfin, après de terribles inondations. Yakari est inquiet pour ses amis les animaux. Avec Petit Tonnerre, il va voir comment ils ont supporté la montée des eaux. Une nuit, le petit Sioux est réveillé par un cri : « Pilipi ! ». L'appel d'un oiseau ? Mystère...

Une équipe de scientifiques financée par un émir va rendre une momie égyptienne à la vie. Les représentants des religions monothéistes s'en émeuvent, des troubles éclatent, des attentats menacent la paix. Lefranc retrouve Axel Borg dans cette aventure dont l'enjeu est d'éviter une guerre mondiale des religions.

Yakari découvre qu'il peut parler avec les arbres, depuis qu'il a rencontré un vieux chêne plutôt bavard. Avec l'aide de ses nouveaux amis, les pécaris et le tatou, il va donner une bonne leçon au chasseur Arc-tendu qui veut sa mort.

Un triste matin, Tilleul est subitement pris de mélancolie. Lui qui ne pensait qu'à faire des farces, le voilà terré dans sa hutte, en proie au vague à l'âme. Alerté, Yakari se démène pour redonner le goût de vivre à son ami le jeune castor. Il comprend bientôt que seul un remède magique apportera la guérison. Ce remède viendra du ciel, sous les apparences d'un pélican bienveillant...

Autour du feu de camp, chacun écoute le chef de la tribu évoquer les temps anciens et cruels où les premiers Hommes Rouges chassaient les hardes de bisons aux cornes géantes. Yakari est fasciné. Il veut revoir les bisons, afin de mieux les connaître. Il retrouve le grand troupeau et assiste, par hasard, au vêlage d'une bisonne. Mais Yakari n'est pas seul : un loup bête et méchant guette déjà le nouveau-né, bien décidé à s'en repaître !

Par une nuit sans lune, tous les chevaux de la tribu de Yakari ont été volés. Tous, à l'exception de l'indomptable Petit Tonnerre. Grâce à son poney, le courageux petit Sioux trouvera le camp des voleurs. Mais comment affronter des ennemis en si grand nombre ? Yakari usera de ruses, recourra aux services du polatouche(un charmant écureuil volant), avant de découvrir les vertus du fameux « baumes des Sénécas », qui guérit les plaies des animaux et soulage des humains...

Un temps horriblement lourd a transformé la Prairie en fournaise. La tribu de Yakari a les nerfs à vif. Un vent mauvais l'agite... Personne ne se doute que cette agitation annonce le passage d'une tornade. Et c'est le cataclysme ! Happés par le tourbillon fou, les tipis s'envolent, les chevaux et les hommes aussi !

Au gros de cet hiver, la tribu de Yakari ne mange pas à sa faim. Et voilà qu'on a volé sa maigre réserve de viande. Qui est le coupable ? Ce doit être un ennemi cruel, car il a massacré les chiens que les chasseurs ont lancés à sa poursuite. Serrait-ce un ours ? Impossible : les ours hibernent. Ce sont pourtant des traces de plantigrade que Yakari a découvertes en se rendant chez les castors, à qui il demande de fabriquer un piège...

Pour la première fois, Yakari rencontre l'animal le plus rapide des Grandes Plaines : l'antilope à cornes fourchues, appelée aussi pronhorn. Un sinistre matin, le feu ravage la Prairie, semant la panique parmi les antilopes. Un faon a disparu et c'est l'affolement. Il sera sauvé par un porc-épic...

La tribu de Yakari campe sur une des voies de migration des oies sauvages et celles-ci ont choisi une falaise toute proche comme aire de repos. Pour le jeune Indien et son poney Petit Tonnerre, c'est l'occasion de bavarder avec ces messagères du printemps. L'une d'elles se tient inexplicablement à l'écart de la conversation. A quelle étrange besogne se livre-t-elle parmi les rochers ?

Un vaisseau spatial est dirigé par une gamine délurée, Zoé Zinzolin, et ses petits frères, Zan et Zef. Tous trois ont libéré les animaux du zoo voisin et quittent la terre pour un voyage interstellaire en compagnie de cette faune rigolote.